![ストーリー](http://www.movienet.co.jp/images/movie_icon_story.gif)
師であるアイアンマンことトニー・スタークから託されたヒーローとしての責任。ピーターは悲しみを忘れるため、街の平和に務めていた。そしてようやく訪れた夏休み。ピーターは大好きなMJ、親友のネッド達と共に楽しみにしていたヨーロッパ旅行に出かける。
しかし、最高の夏休みにしたいと願うピーターを待っていたのは元S.H.I.E.L.D長官のニック・フューリーだった。迫り来る新たな脅威を察したニックは、異次元から来たというミステリオと共に戦う準備を始めていた。そこにスパイダーマンの力も必要としていたのだ。
突如としてヴェネチアに出現した巨大な人型の“水”。その圧倒的なパワーに翻弄されるピーター、スパイダーマンに替わり、果敢に戦いを挑むミステリオ。ヴェネチア以外でも、“火”や“土”の巨大な敵が現れ、ニックを中心とした攻防戦が続く中、ピーターは決意する。トニーの意思を引き継ぎ、真のヒーローになることを。